Контрольно-счётная палата Нефтеюганского района является органом местного самоуправления муниципального образования Нефтеюганский район, образованным в соответствии с Уставом Нефтеюганского муниципального района Ханты-Мансийского автономного округа – Югры Думой Нефтеюганского района.
Контрольно-счетная палата является постоянно действующим органом внешнего муниципального финансового контроля муниципального образования Нефтеюганский район и осуществляет полномочия по организации и контролю за законностью и эффективностью использования средств бюджета Нефтеюганского района, а также иных средств в случаях, предусмотренных законодательством Российской Федерации.